Kari mengalami mimpi buruk yang berulang dan masuk ke dalam Dark Ocean, sebuah dunia yang terpisah dari Dunia Nyata dan Digital. Para Scubamon meminta Kari untuk membebaskan mereka dari kendali Ken, dan mereka diserang oleh Airdragon. T.K. memasuki Dark Ocean untuk menyelamatkan Kari dan menghancurkan Menara Kontrol, tetapi begitu Scubamon dibebaskan, mereka berusaha menculiknya untuk menjadi ratu bagi tuan mereka, Dragomon. Keduanya, bersama dengan Digimon mereka, melarikan diri.