Pada musim panas tahun pertama di SMA, Hodaka melarikan diri dari rumahnya di pulau terpencil ke Tokyo, dan dengan cepat mendapati dirinya terdesak hingga ke batas keuangan dan pribadinya. Cuaca sangat suram dan hujan turun setiap hari, seakan-akan mengambil alih kehidupannya. Setelah berhari-hari menyendiri, dia akhirnya mendapatkan pekerjaan sebagai penulis lepas untuk sebuah majalah gaib yang misterius. Kemudian, suatu hari, Hodaka bertemu dengan Hina di sudut jalan yang sibuk. Gadis yang cerdas dan berkemauan keras ini memiliki kemampuan yang aneh dan luar biasa: kekuatan untuk menghentikan hujan dan membersihkan langit.