Conan, Haibara, Ayumi, Genta, dan Mitsuhiko mengunjungi Sekolah Dasar Teitan untuk merawat kelinci. Seorang pria yang mereka temui di sana melihat Haibara dan bertanya apakah dia adik perempuan Miyano Akemi, Shiho. Pertanyaannya membuat Haibara takut, tetapi dia adalah lulusan Sekolah Dasar Teitan, Murata Sho. Mantan teman sekelasnya, Yanagimachi Gaku dan Ichihashi Seiko bergabung dengannya, dan Conan dan Detective Boys mengetahui bahwa Akemi pernah bersekolah di SD Teitan. Para lulusan berencana untuk menggali kapsul waktu yang mereka kubur ketika mereka lulus, tetapi hanya Akemi yang tahu di mana kapsul itu dikubur…