Conan, Ai, dan Detective Boys bertemu dengan pengedar narkoba yang sedang melarikan diri. Pengedar narkoba kehilangan buku catatannya dan Conan menemukan ada kode di dalamnya tentang pertukaran narkoba yang akan berlangsung pada hari yang sama. Untuk menghentikannya, pertama-tama mereka harus memecahkan kodenya dan menemukan lokasi serta waktu yang tepat terjadinya transaksi narkoba. Detective Boys menghubungi Heiji dan mereka menentukan bahwa kode tersebut terhubung ke jaringan kereta api untuk kedua kota mereka.