Setelah pembantaian kejam terhadap keluarganya oleh tentara bayaran Sub-Zero yang sangat dingin, Hanzo Hasashi diasingkan ke Netherrealm yang penuh siksaan. Di sana, sebagai ganti dari pengabdiannya pada Quan Chi yang jahat, dia diberi kesempatan untuk membalaskan dendam keluarganya – dan dibangkitkan sebagai Scorpion, jiwa yang tersesat yang bertekad untuk membalas dendam. Kembali ke Earthrealm, Lord Raiden mengumpulkan tim prajurit elit – biksu Shaolin Liu Kang, perwira Pasukan Khusus Sonya Blade, dan bintang laga Johnny Cage – sekelompok pahlawan yang tidak mungkin dengan satu kesempatan untuk menyelamatkan umat manusia. Untuk melakukan ini, mereka harus mengalahkan gerombolan gladiator Outworld Shang Tsung dan menguasai turnamen Mortal Kombat.