“Kelas Hitam,” Kelas 10 Akademi Myōjō terdiri dari 12 pembunuh yang menyamar sebagai siswa dan satu target: Haru Ichinose. Menyadari sepenuhnya bahwa dirinya adalah mangsa, Ichinose bersumpah untuk selamat dari upaya pembunuhan dan lulus dari sekolah dalam keadaan hidup. Salah satu pembunuh, Tokaku Azuma, mulai membangun perasaan terhadap Ichinose dan beralih menjadi pelindungnya. Bersama-sama mereka harus menghadapi serangan dari teman sekelas mereka yang terdiri dari 11 pembunuh bayaran.