Dalam masyarakat yang futuristik, Jepang telah menerapkan sistem kompleks yang disebut sebagai “Benang Merah Ilmu Pengetahuan” untuk mendorong pernikahan yang sukses dan memerangi angka kelahiran yang semakin rendah. Berdasarkan perhitungan kecocokan, generasi muda pada usia 16 tahun ditetapkan sebagai pasangan nikah oleh pemerintah, dan dampak buruk menanti mereka yang tidak menaati pengaturan tersebut. Bagi Yukari Nejima, seorang remaja yang menganggap dirinya rata-rata dalam segala hal, sistem ini mungkin merupakan cara terbaiknya untuk menjalani kehidupan yang memuaskan.
Namun, didorong oleh ketertarikannya pada teman sekelas dan kekasih lamanya, Misaki Takasaki, Yukari menentang sistem dan menyatakan cintanya. Setelah beberapa keengganan awal, Misaki membalas perasaannya di saat yang penuh gairah. Sayangnya, sebelum keduanya melanjutkan hubungan mereka, Yukari menerima pemberitahuan pernikahannya. Dia kemudian dilemparkan ke dalam jaringan cinta dan kebohongan yang membingungkan ketika rekannya yang ditugaskan, Ririna Sanada, menjadi terpesona dengan kisah cinta terlarangnya.